SEMA4D

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1OLZ, 3OL2

Ідентифікатори

Символи

SEMA4D, C9orf164, CD100, M-sema-G, SEMAJ, coll-4, semaphorin 4D, COLL4, A8, GR3, BB18

Зовнішні ІД

OMIM: 601866 MGI: 109244 HomoloGene: 21282 GeneCards: SEMA4D

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding • transmembrane signaling receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • semaphorin receptor binding • neuropilin binding • identical protein binding • signaling receptor activity • chemorepellent activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана • міжклітинний простір
Біологічний процес	• regulation of dendrite morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • multicellular organism development • leukocyte aggregation • нейробіологія розвитку • negative regulation of cell adhesion • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • positive regulation of axonogenesis • semaphorin-plexin signaling pathway involved in bone trabecula morphogenesis • regulation of cell projection organization • negative regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of collateral sprouting • regulation of cell shape • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • диференціація клітин • positive regulation of protein phosphorylation • semaphorin-plexin signaling pathway • адгезія клітин • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • ossification involved in bone maturation • positive regulation of cell migration • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of alkaline phosphatase activity • negative chemotaxis • neural crest cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • positive regulation of inhibitory synapse assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10507


20354

Ensembl


ENSG00000187764


ENSMUSG00000021451

UniProt


Q92854


O09126

RefSeq (мРНК)

NM_001142287 NM_006378 NM_182635 NM_001371194 NM_001371195
NM_001371196 NM_001371197 NM_001371198 NM_001371199 NM_001371200 NM_001371201 NM_001371202


NM_001281880 NM_013660

RefSeq (білок)

NP_001135759 NP_006369 NP_001358123 NP_001358124 NP_001358125
NP_001358126 NP_001358127 NP_001358128 NP_001358129 NP_001358130 NP_001358131

NP_001268809 NP_038688 NP_001365242 NP_001365243 NP_001365246
NP_001365247 NP_001365248 NP_001365249 NP_001365251 NP_001365252 NP_001365253 NP_001365244 NP_001365245 NP_001365250 NP_001365254

Локус (UCSC)

Хр. 9: 89.36 – 89.5 Mb

Хр. 13: 51.69 – 51.79 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SEMA4D (англ. Semaphorin 4D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 96 150^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRMCTPIRGL	LMALAVMFGT	AMAFAPIPRI	TWEHREVHLV	QFHEPDIYNY
SALLLSEDKD	TLYIGAREAV	FAVNALNISE	KQHEVYWKVS	EDKKAKCAEK
GKSKQTECLN	YIRVLQPLSA	TSLYVCGTNA	FQPACDHLNL	TSFKFLGKNE
DGKGRCPFDP	AHSYTSVMVD	GELYSGTSYN	FLGSEPIISR	NSSHSPLRTE
YAIPWLNEPS	FVFADVIRKS	PDSPDGEDDR	VYFFFTEVSV	EYEFVFRVLI
PRIARVCKGD	QGGLRTLQKK	WTSFLKARLI	CSRPDSGLVF	NVLRDVFVLR
SPGLKVPVFY	ALFTPQLNNV	GLSAVCAYNL	STAEEVFSHG	KYMQSTTVEQ
SHTKWVRYNG	PVPKPRPGAC	IDSEARAANY	TSSLNLPDKT	LQFVKDHPLM
DDSVTPIDNR	PRLIKKDVNY	TQIVVDRTQA	LDGTVYDVMF	VSTDRGALHK
AISLEHAVHI	IEETQLFQDF	EPVQTLLLSS	KKGNRFVYAG	SNSGVVQAPL
AFCGKHGTCE	DCVLARDPYC	AWSPPTATCV	ALHQTESPSR	GLIQEMSGDA
SVCPDKSKGS	YRQHFFKHGG	TAELKCSQKS	NLARVFWKFQ	NGVLKAESPK
YGLMGRKNLL	IFNLSEGDSG	VYQCLSEERV	KNKTVFQVVA	KHVLEVKVVP
KPVVAPTLSV	VQTEGSRIAT	KVLVASTQGS	SPPTPAVQAT	SSGAITLPPK
PAPTGTSCEP	KIVINTVPQL	HSEKTMYLKS	SDNRLLMSLF	LFFFVLFLCL
FFYNCYKGYL	PRQCLKFRSA	LLIGKKKPKS	DFCDREQSLK	ETLVEPGSFS
QQNGEHPKPA	LDTGYETEQD	TITSKVPTDR	EDSQRIDDLS	ARDKPFDVKC
ELKFADSDAD	GD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Basile J.R., Afkhami T., Gutkind J.S. (2005). Semaphorin 4D/plexin-B1 induces endothelial cell migration through the activation of PYK2, Src, and the phosphatidylinositol 3-kinase-Akt pathway. Mol. Cell. Biol. 25: 6889—6898. PMID 16055703 DOI:10.1128/MCB.25.16.6889-6898.2005
Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10732 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92854 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації

1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50

51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100

101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150

151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200

201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249

251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299

301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350