TNFRSF10B

TNFRSF10B
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1D0G, 1D4V, 1DU3, 1ZA3, 2H9G, 4I9X, 4N90, 4OD2, 3X3F

Ідентифікатори
Символи TNFRSF10B, CD262, DR5, KILLER, KILLER/DR5, TRAIL-R2, TRAILR2, TRICK2, TRICK2A, TRICK2B, TRICKB, ZTNFR9, tumor necrosis factor receptor superfamily member 10b, TNF receptor superfamily member 10b
Зовнішні ІД OMIM: 603612 MGI: 1341090 HomoloGene: 117702 GeneCards: TNFRSF10B
Пов'язані генетичні захворювання
head and neck squamous cell carcinoma[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• TRAIL binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• tumor necrosis factor-activated receptor activity
• signaling receptor activity

Клітинна компонента

• мембрана
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• cell surface
• внутрішньоклітинний
• integral component of membrane

Біологічний процес

• activation of NF-kappaB-inducing kinase activity
• response to endoplasmic reticulum stress
• multicellular organism development
• cell surface receptor signaling pathway
• response to lipopolysaccharide
• intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress
• cellular response to mechanical stimulus
• regulation of cell population proliferation
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors
• inflammatory response
• activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
• GO:0097285 апоптоз
• negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors
• leukocyte migration
• extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors
• regulation of apoptotic process
• negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• TRAIL-activated apoptotic signaling pathway
• positive regulation of apoptotic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8795
21933
Ensembl
ENSG00000120889
ENSMUSG00000022074
UniProt
O14763
Q9QZM4
RefSeq (мРНК)
NM_003842
NM_147187
NM_020275
RefSeq (білок)
NP_003833
NP_671716
NP_064671
Локус (UCSC) Хр. 8: 23.02 – 23.07 Mb Хр. 14: 70 – 70.02 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TNFRSF10B (англ. TNF receptor superfamily member 10b) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 440 амінокислот, а молекулярна маса — 47 878[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEQRGQNAPAASGARKRHGPGPREARGARPGPRVPKTLVLVVAAVLLLVS
AESALITQQDLAPQQRAAPQQKRSSPSEGLCPPGHHISEDGRDCISCKYG
QDYSTHWNDLLFCLRCTRCDSGEVELSPCTTTRNTVCQCEEGTFREEDSP
EMCRKCRTGCPRGMVKVGDCTPWSDIECVHKESGTKHSGEVPAVEETVTS
SPGTPASPCSLSGIIIGVTVAAVVLIVAVFVCKSLLWKKVLPYLKGICSG
GGGDPERVDRSSQRPGAEDNVLNEIVSILQPTQVPEQEMEVQEPAEPTGV
NMLSPGESEHLLEPAEAERSQRRRLLVPANEGDPTETLRQCFDDFADLVP
FDSWEPLMRKLGLMDNEIKVAKAEAAGHRDTLYTMLIKWVNKTGRDASVH
TLLDALETLGERLAKQKIEDHLLSSGKFMYLEGNADSAMS

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
  • Yamaguchi H., Wang H.G. (2004). CHOP is involved in endoplasmic reticulum stress-induced apoptosis by enhancing DR5 expression in human carcinoma cells. J. Biol. Chem. 279: 45495—45502. PMID 15322075 DOI:10.1074/jbc.M406933200
  • Nemcovicova I., Benedict C.A., Zajonc D.M. (2013). Structure of human cytomegalovirus UL141 binding to TRAIL-R2 reveals novel, non-canonical death receptor interactions. PLoS Pathog. 9: E1003224—E1003224. PMID 23555243 DOI:10.1371/journal.ppat.1003224

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNFRSF10B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11905 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, O14763 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350